Le nom de Sainte-Apolline-de-Patton fait référence aux vertus héroïques d’une jeune martyrisée à Alexandrie en l’an 249, sous le règne de l’empereur Dèce. Celle-ci refusant de renier sa foi, ses bourreaux lui brisèrent les dents et elle se jeta volontairement dans les flammes du bûcher allumé à son intention. Sainte-Apolline est aussi la patronne des dentistes.

La dénomination «Patton» reprend le nom du canton proclamé en 1871 où se situe la municipalité et qui est ouvert en la mémoire d’un marchand de bois et dernier seigneur de la Seigneurie de la Rivière-du-Sud, «Sir William Randall Patton».

C’est en 1877 que les premiers colons commencent à remonter la route de L’Anse-à-Gilles (route de l’Espérance) pour s’installer sur les terres des Cantons de Bourdages et Patton. Les premiers arrivés sont Joseph Bernier (Firmin), son frère Théophile Bernier et William Guimond. Les colons sont desservis à titre de mission par le curé de Cap-Saint-Ignace dans les premières années, ensuite par le curé de Saint-Cyrille, et de 1889 à 1894, par le curé de Notre-Dame-du-Rosaire. La première chapelle est érigée en 1894. Elle est détruite par des intempéries peu après son érection et rebâtie en 1896. Cette chapelle est aujourd’hui la sacristie. L’année 1902 marque plusieurs évènements importants. La paroisse accueille l’abbé Armand Verreault, son premier curé résident, et ouvre ses registres tandis que les paroissiens construisent le presbytère.